Le GIP FCIP d’Aquitaine est un organisme public autonome financièrement et administrativement relevant du ministère de l’Éducation nationale et de la jeunesse. 

Il est présidé par Madame Anne BISAGNI-FAURE, Rectrice de l’académie de Bordeaux, Chancelière des universités d’Aquitaine. Il est dirigé par  Monsieur Thierry KESSENHEIMER